86 citations
- Centre Inria de l'Université de RennesFR2 papers
- Centre National de la Recherche ScientifiqueFR2 papers
- Institut de Recherche en Informatique et Systèmes AléatoiresFR2 papers
- Hôpital PontchaillouFR1 paper
- Laboratoire d'Informatique, de Robotique et de Microélectronique de MontpellierFR1 paper
- Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'EnvironnementFR1 paper
- Université de MontpellierFR1 paper
- Université de RennesFR1 paper
- Université Paris-SaclayFR1 paper
2 papers
q-bio.GN2016★ 15 cited
Multiple Comparative Metagenomics using Multiset k-mer Counting
Gaëtan Benoit, Pierre Peterlongo, Mahendra Mariadassou +4
Background. Large scale metagenomic projects aim to extract biodiversity knowledge between different environmental conditions. Current methods for comparing microbial communities f…
cs.DS2015★ 86 cited
Read Mapping on de Bruijn graph
Antoine Limasset, Bastien Cazaux, Eric Rivals +1
Background Next Generation Sequencing (NGS) has dramatically enhanced our ability to sequence genomes, but not to assemble them. In practice, many published genome sequences remain…